Solução:

Verifique se o CNPJ do emitente foi informado corretamente na NF-e (campo localizado na aba de emitente), caso contrário , realize o preenchimento do CNPJ correto.

Caso esteja correto o CNPJ do emitente, é preciso confirmar se o Certificado Digital usado para assinar a NF-e é realmente o certificado emitido para o CNPJ do emitente.

Campo no ConfigExtractor:

Feitas as alterações, basta reenviar a NF-e.