Solução:

Verifique se o tipo de operação (tpNF) da NF-e esta "1"  (Saída), então é preciso manter o CFOP, pois o mesmo já indica uma operação de saída e modificar o tipo de operação da NF-e de  "0" para "1" ou se o tipo de operação (tpNF) da NF-e estiver "0", deve-se manter o tipo de operação da NF-e e modificar o CFOP, utilizando um que inicie por "1, 2 ou 3", indicando uma operação de entrada.

Campo no ConfigExtractor:

Feitas as alterações , basta reenviar.